Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1AO95602 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms