Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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KDM4BO94953 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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KDM4BO94953 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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KDM4BO94953 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KDM4BO94953 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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