Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM2O94769 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM2O94769 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM2O94769 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM2O94769 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM2O94769 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM2O94769 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM2O94769 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM2O94769 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM2O94769 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECM2O94769 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECM2O94769 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECM2O94769 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECM2O94769 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms