Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EIF3JO75822 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EIF3JO75822 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms