Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRP5O75197 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRP5O75197 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5O75197 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5O75197 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5O75197 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5O75197 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5O75197 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5O75197 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP5O75197 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms