Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC9O60706 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ABCC9O60706 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC9O60706 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC9O60706 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC9O60706 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC9O60706 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC9O60706 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC9O60706 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC9O60706 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC9O60706 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
ABCC9O60706 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms