Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PDE6DO43924 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDE6DO43924 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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