Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP3K13O43283 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MAP3K13O43283 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MAP3K13O43283 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MAP3K13O43283 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP3K13O43283 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP3K13O43283 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP3K13O43283 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP3K13O43283 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP3K13O43283 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP3K13O43283 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MAP3K13O43283 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms