Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BCKDKO14874 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BCKDKO14874 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms