Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APAF1O14727 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APAF1O14727 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APAF1O14727 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APAF1O14727 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APAF1O14727 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms