Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ZNF561-AS1K7EIQ3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms