Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MCRIP1C9JLW8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms