Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCE3A1L190 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCE3A1L190 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCE3A1L190 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYCE3A1L190 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms