Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
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