Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms