Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms