Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms