Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP1Q9Y3L3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP1Q9Y3L3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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SH3BP1Q9Y3L3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SH3BP1Q9Y3L3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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