Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms