Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UTP11Q9Y3A2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms