Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPS28Q9Y2Q9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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