Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERGIC3Q9Y282 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERGIC3Q9Y282 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms