Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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