Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PADI1Q9ULC6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms