Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5BQ9UGL1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5BQ9UGL1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms