Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms