Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EHD3Q9NZN3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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