Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX55

HYPK, Huntingtin-interacting protein K, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HYPKQ9NX55 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HYPKQ9NX55 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HYPKQ9NX55 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HYPKQ9NX55 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HYPKQ9NX55 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HYPKQ9NX55 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HYPKQ9NX55 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HYPKQ9NX55 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HYPKQ9NX55 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HYPKQ9NX55 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms