Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHBDL2Q9NX52 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHBDL2Q9NX52 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms