Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HPF1Q9NWY4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HPF1Q9NWY4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms