Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms