Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TBCCD1Q9NVR7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms