Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKDREJQ9NTG1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PKDREJQ9NTG1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms