Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEPEQ9NQ76 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms