Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COG4Q9H9E3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms