Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00597Q9H2U6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms