Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CIPCQ9C0C6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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