Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP74Q9C0B2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP74Q9C0B2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms