Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLRP1Q9C000 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP1Q9C000 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms