Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLDIP3Q9BY77 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms