Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms