Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EBF4Q9BQW3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms