Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMSS1Q9BQ75 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms