Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms