Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOPXQ9BPY8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOPXQ9BPY8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms