Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PIK3R4Q99570 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIK3R4Q99570 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms