Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CDRT15Q96T59 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CDRT15Q96T59 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CDRT15Q96T59 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CDRT15Q96T59 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CDRT15Q96T59 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDRT15Q96T59 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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