Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NSMCE2Q96MF7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms