Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRIQ1Q96JM4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRIQ1Q96JM4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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