Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC34Q96HJ3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC34Q96HJ3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms